La coloration Rhodanine est utilisée en histologie pour visualiser les dépôts de cuivre dans les tissus. La réaction utilise la propriété du cuivre à se fixer avec une forte affinité aux dépôts de cuivre protéique dans des coupes de tissus.

On retrouve des dépôts de cuivre en excès dans les protéines cytoplasmiques des cellules dans de nombreuses pathologies liées au foie comme l'obstruction biliaire chronique et l'hépatite chronique. La quantification après coloration rhodamine sur des coupes de tissus est la méthode la plus utilisée pour mettre en avant la présence de dépôts de cuivre anormaux.

La coloration Rhodamine est surtout utilisée dans le cadre du diagnostic de la maladie de Wilson pour son gain en sensibilité comparé au test à l'acide rubéanique. Cette maladie entraine un excès de cuivre qui provoque des dommages sur le foie pouvant aller jusqu'à l'hépatite aigüe et un état de cirrhose avancé. L'excès de cuivre dans de cas de la maladie de Wilson peut également se retrouver dans le cerveau et dans la cornée des yeux.