Préparation de banques ARN pour le NGS

Le transcriptome est l'ensemble complet de transcrits dans une cellule, et leur quantité, pour un stade de développement spécifique ou une condition physiologique. Il comprend principalement l'ARNm et l'ARN non codant.

Comprendre le transcriptome est essentiel pour interpréter les éléments fonctionnels du génome et révéler les constituants moléculaires des cellules et des tissus, et aussi pour comprendre le développement et la maladie.

Le séquençage de l'ARN (RNA-seq), également appelé whole transcriptome shotgun sequencing (WTSS), utilise le séquençage de nouvelle génération (NGS) pour révéler la présence et la quantité d'ARN dans un échantillon biologique à un moment donné.

Le séquençage de l'ARN est utilisé pour analyser le transcriptome cellulaire en constante évolution. Plus précisément, il facilite la recherche d'autres transcrits épissés par des gènes, des modifications post-transcriptionnelles, de la fusion de gènes, des mutations / SNP et des modifications de l'expression des gènes. En plus des transcrits d'ARN, le séquençage de l'ARN permet d'examiner différentes populations d'ARN qui inclues l'ARN total, les petits ARN, tels que les micro ARN (miRNA), l'ARNt et le profilage ribosomique. Il peut également être utilisé pour déterminer les limites d'exon / intron et vérifier ou modifier les limites de gène 5 'et 3' précédemment annotées.