Le séquençage nouvelle génération (NGS) est un outil puissant pour le séquençage à grande échelle et à haute définition. Il existe différents types de séquençage. La technologie la plus utilisée actuellement est la technologie de séquençage par synthèse (ou séquençage Illumina). Mais il existe également d’autres technologies comme la technologie Ion Torrent.

Le séquençage Ion Torrent est une méthode de séquençage basée sur la détection d’ions hydrogènes libérés durant la polymérisation de l’ADN. C’est une méthode de séquençage par synthèse durant laquelle un brin complémentaire est créé à partir d’une matrice. Le séquençage Ion Torrent est constitué de 4 étapes principales : la construction de la banque, l’amplification, le séquençage et l’analyse.  Contrairement au séquençage Illumina, le séquençage Ion Torrent ou Ion proton n'utilise pas de signaux optiques. Il exploite plutôt le fait que l'ajout d'un dNTP à un polymère d'ADN libère un ion H+. Comme dans d'autres types de NGS, l'ADN ou l'ARN d'entrée est fragmenté, en fragments d’environ 200bp. Des adaptateurs sont ajoutés et une molécule est placée sur une bille. Les molécules sont amplifiées sur la bille par PCR en émulsion. Chaque bille est ensuite placée dans un seul puits d'une lame.