Le rouge alizarine est un colorant dérivé de la famille des anthraquinones. Il est couramment utilisé en histologie pour mettre en évidence les dépôts calciques des tissus en se fixant au calcium par un processus de chélation. Cette réaction permet la formation de complexes rouge alizarine -Calcium, composé biréfringent dont les dépôts apparaissent en rouge au microscope optique.

La réaction n'est pas totalement spécifique pour le calcium car d'autres composés peuvent réagir avec ce colorant comme le magnésium, le manganèse, le fer, le barrium et le strontium. Mais la plupart du temps il n'y a pas d'interférence puisque ces composés ne se retrouvent pas en concentration suffisante dans les tissus biologiques pour pouvoir interagir avec la coloration du calcium.

La coloration au rouge alizarine est utilisée pour détecter la présence de dépôts de calcium dans un tissu ou un système vasculaire. Elle peut également servir pour caractériser la croissance osseuse, l'ostéoporose ou la moelle osseuse dans le cadre de l'étude d'une signalisation cellulaire, de l'expression génique, de cellules souches mésenchymateuses, …