Le séquençage au bisulfite (BiSeq) consiste à utiliser un traitement de l’ADN au bisulfite de sodium avant d’effectuer le séquençage de celui-ci. Ce traitement a pour but de déterminer le profil de méthylation de l’ADN. Le bisulfite de sodium désamine les cytosines non méthylées plus rapidement que les méthylées. Ce traitement qui converti les cytosines en uraciles puis en thymines après amplification permet de transformer la marque épigénétique en variation génétique identifiable par séquençage. Le séquençage nouvelle génération (NGS) permet désormais d’étudier le méthylome (l’ADN méthylé) sur le génome entier avec une haute résolution (de l’ordre de la paire de bases). La méthylation de l’ADN est l’une des modifications épigénétiques les plus étudiées. En effet, ce processus joue un rôle important dans la régulation de l’expression génétique et par conséquent dans de nombreux processus biologiques et dans un large éventail de pathologies.

Le protocole du séquençage au bisulfite consiste à préparer des fragments d’ADN par sonication , les indexer avec des adaptateurs methylés puis les sélectionner par la taille. Les banques sont ensuite traitées au bisulfite de sodium, amplifiés et séquencés. La réaction de conversion peut être vérifiée en intégrant un ADN contrôle non méthylé.