Les milieux de montage non aqueux sont également appelés milieux de montage anhydres ou organiques. Il s'agit de milieux de montage à base de solvants organiques, des résines naturelles ou synthétiques dissoutes dans du benzène, du toluène ou du xylène. Ils sont utilisés pour faire le montage de coupes de tissus après leur coloration. Ces milieux de montage dépourvus d'eau protègent l'échantillon et assurent la brillance optique du colorant. Cependant, il est nécessaire d'ajouter une étape de déshydratation afin d'éviter la présence d'eau sur la coupe qui ferait interférence avec le milieu de montage. 

Les milieux de montage organiques peuvent être uniquement utilisés pour les marquages enzymatiques pour lesquels le précipité formé entre l'enzyme et le chromogène n'est pas soluble dans les solvants organiques utilisés lors du montage.

Il existe des milieux de montage permanents et non permanents. Les milieux de montage anhydres sont généralement permanents et sont donc des milieux de montage qui peuvent être utilisés pour le stockage à long terme des coupes de tissus colorées.