Séquençage d'anticorps
Connaître la séquence de votre anticorps monoclonal est non seulement la première étape vers l'ingénierie des anticorps et de leur optimisation, mais également pimordial pour la demande de brevet
Ce que vous fournissez :
L'anticorps monoclonal à séquencer (>0.2mg, >95%pure)
Ce que nous vous fournissons :
- la séquence complète des chaînes lourdes et légères
- la séquence complète du profil obtenu par LC-MS/MS
- un rapport complet
- les données brutes obtenues en LC-MS/MS
Bénéfices du service :
- La capacité de reconstruire un hybridome à partir d'un échantillon d'anticorps monoclonal
- La détermination des régions CDR
- Les analyses de confirmation comme la séquence primaire, les PTM, les sites de glycosilation et la variabilité de séquence
Présentation du service :
Ce service permet de séquencer un anticorps en utilisant une digestion avec plusieurs enzymes et du LC-MS/MS haute résolution. Nous vous garantissons un séquençage complet des chaînes lourdes et légères.
Notre processus de séquençage ne requiert pas d'hybridome, d'ARNm ou d'autres informations sur la séquence.
Précis - Nous garantissons au moins une couverture 5X des CDR dans les régions variables. Chaque acide aminé dans les CDR est analysés par au moins 5 balayages MS2. Pour les Leu et Ile isomériques, nous nous efforçons de faire une inférence correcte de la spécificité de l'enzyme et les statistiques dans la base de données d'anticorps.
Complet - Nous proposons, en option, une caractérisation de votre anticorps. Notre service inclus les analyses des PTM, de la glycosylation, des ponts disulfures, des contaminants, et d'autres aspects dont vous pourriez avoir besoin.
Efficace - Nous utilisons de petits volumes d'anticorps (0.2 mg) et vous fournissons les résultats en environ 15 jours.
Méthode
Le séquençage consiste en plusieurs étapes :
- Digestion de l'anticorps avec différentes enzymes
- Analyses des digestions par LS-MS/MS avec le Thermo Orbitrap
- Caractérisation des peptides par séquençage de novo
- Assemblage automatique des peptides caractérisés